【新冠病毒-Part 3】樣本收集保存、處理、NGS測序…

 

在前期中,小艾為大家整理了【新冠病毒-Part 1】2019-nCoV 蛋白、抗體、試劑盒和【新冠病毒-Part 2】疫苗開發相關產品等部分內容,相信大家對這些內容已經有所了解了。那么如何對樣本進行收集保存?如何進行樣本核酸提取?以及如何進行NGS(二代測序或者高通量測序)?小艾將最近收集整理的病毒樣本處理相關產品線分享給大家,希望對科研,研發,診斷的小伙伴們有所幫助,也需要大家幫忙分享傳播~

 

產品線串聯圖譜總覽:

【1】各類樣本收集保存等相關產品:

 

分類 名稱 貨號 上樣量 規格
血液 cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes 63950 8.4ml 50管
尿液 Urine Collection and Preservation Tube 5 cc 18116 1-5ml 1管
Urine Collection and Preservation Tube 5 cc (50 Units) 18118 1-5ml 50管
Urine Collection and Preservation Tube 15 cc 18120 5-15ml 1管
Urine Collection and Preservation Tube 15 cc (50 Units) 18122 5-15ml 50管
Urine Collection and Preservation Tube 50 cc 18111 5-45ml 1管
Urine Collection and Preservation Tube 50 cc (50 Units) 18113 5-45ml 50管
Urine Collection and Preservation Cup 120 cc 18129 100-120ml 1個
Urine Preservative Single Dose(尿液防腐劑) 18124 —— 單劑量
Urine Preservative Single Dose (50 Units)(尿液防腐劑) 18126 —— 50單位
唾液 Saliva DNA Collection and Preservation Devices (50) RU49000 2 mL 50次
Saliva RNA Collection and Preservation Devices RU53800 2 mL 50次
Saliva Exosome Collection and Preservation Kit 65400 2 mL 50次
Swab Collection and DNA Preservation System(采集鼻,頰,唾液,糞便,皮膚表面等樣品DNA) 45690 —— 50次
糞便 Stool Nucleic Acid Collection and Preservation Tube 45630 2 g 1管
Stool Nucleic Acid Collection and Preservation Tubes 45660 2 g 50管
Stool Nucleic Acid Collection and Preservation System 63700 2 g 50次
Fecal DNA Collection & Preservation Mini Tubes 27650 ≤ 30 mg 12管
Fecal Swab Collection and Preservation System 45670 —— 50次

 

【2】樣本中病毒核酸的提取和濃縮等:

 

分類 名稱 貨號
核酸提取 Viral DNA extraction kit(病毒DNA) K1446
96-well Viral DNA/RNA Kit(病毒DNA/RNA) K1417
Total RNA Purification Kit(總RNA) 17200,37500,17250
Total RNA Purification Plus Kit(總RNA) 48300,48400
Urine Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Midi Kit(尿液,中提) 60000
Urine Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Maxi Kit(尿液,中提) 60100
Urine Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Mini Kit(尿液,小提) 59900
Plasma/Serum Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Midi Kit(血漿/血清,中提) 56400
Plasma/Serum Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Mini Kit(血漿/血清,小提) 56300
Plasma/Serum Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Maxi Kit(血漿/血清,大提) 56500
病毒濃縮 PEG Virus Precipitation Kit(PEG病毒沉淀) K904

 

【3】NGS(二代測序)相關產品:

 

二代測序(NGS)可以同時給數以萬計的DNA分子進行測序。這種可以多個樣本同時測序的能力,在個性化醫療、遺傳疾病和臨床診斷等方面開創了革命性的領域。雖然不同的高通量測序機器生產時會在技術細節上有許多不同,但他們都有以下幾個共同點:

 

  1. 文庫建立:所有二代測序的平臺都需要一個基因文庫,這個基因文庫包含通過引申或者連接自定義的接頭序列。
  2. 測序儀器:每個文庫片段在DNA連接因子的作用下,以文庫適配序列為模版,在固體表面上進行擴增。這步擴增會產生許多DNA蔟,每個來源于一個文庫片段,每個基因蔟都會像獨立的測序反應一樣起作用。
  3. 數據輸出:每個儀器都會在測序結束后給出原始數據。這個原始數據是每個基因蔟中形成的DNA序列的集合。

 

不同的二代測序平臺的區別主要體現在測序反應的技術上,這些差別可以分為4類:焦磷酸測序,合成法測序,連接法測序和離子半導體測序。

 

樣本類型 分類 名稱 貨號

RNA樣本
重亞硫酸鹽轉化 Methylamp RNA Bisulfite Conversion Kit P-9003
cDNA合成 EpiNext Hi-Fi cDNA Synthesis Kit P-9004
建庫 EpiNext DNA Library Preparation Kit (Illumina) P-1051
EpiNext High-Sensitivity DNA Library Preparation Kit (Illumina) P-1053
NGS條形碼 EpiNext NGS Barcode (Index) Set-12 P-1060
小RNA建庫 Small RNA Library Prep Kit for Illumina 63610
Small RNA Library Prep Kit for Illumina (Indexes 1-24) 63600
Small RNA Library Prep Kit for Illumina (Indexes 25-48) 63620
文庫定量 NGS Library Quantification Kit (for Small RNA-Seq) 61600
其它 NGS Normalization 96-Well Kit 61900
EpiNext 5-mC RNA Bisulfite-Seq Easy Kit (Illumina) P-9007
EpiNext RNA Bisulfite-Seq Kit (Illumina) P-9006

 

此外,艾美捷代理品牌Epigentek還有其它NGS方案:

 

  1. 5mC DNA Bisulfite Sequencing (重亞硫酸鹽轉化-建庫-測序)

 

重亞硫酸鹽轉化-建庫-測序

 

  1. MeDIP Sequencing (甲基化DNA免疫沉淀-建庫-測序)

 

甲基化DNA免疫沉淀-建庫-測序

 

  1. ChIP Sequencing (染色質免疫沉淀-建庫-測序)

 

 

艾美捷獨家代理品牌Norgen Biotek還提供NGS服務:

  1. 小RNA(microRNA)測序服務
  2. RNA(mRNA)測序服務
  3. 16S微生物組測序服務

主要服務流程為:1.咨詢;2.樣品提交/運輸;3.樣品分離;4. RNA質量控制;5.建庫;6.測序;7.分析;8.最終報告。

 

  • 更多資訊,歡迎收聽艾美捷科技的直播課程,掃描免費收聽(可重復觀看):

 

武漢加油,中國加油!

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